鑒於中國大陸武漢嚴重特殊傳染性肺炎疫情非但沒有平息，武漢市亦於今(23)日10點起全面停止公眾交通運輸營運，顯示疫情有持續擴大跡象，中央流行疫情指揮中心宣布今日起將疫情等級提升至第二級，由衛生福利部陳時中部長擔任指揮官。行政院院長蘇貞昌及陳其邁副院長今日下午親臨指揮中心聽取各部會報告，指示此次防疫應視同作戰，要以嚴謹的態度及最高的準備，做到防疫滴水不漏，各部會務必迅速到位、盤點個管業務，配合現代新科技運用，加強各通路聯繫及衛教宣導，並透過以往的防疫經驗，降低民眾不必要的恐慌。
針對武漢市因應疫情全面停止交通運輸，台商可能滯留武漢一事，目前已通報移民署國境大隊同仁查驗大陸地區人民入境證，如發現居住地或原居住地為武漢者，一律拒絕入境；另通知各航空公司啟程地檢查入境證時，由地勤人員先行檢查入臺證原居住地或出生地欄位，若入臺證該欄位空白未填，則請其出示大陸身分證，若居住地為「湖北省武漢市」者，不准登機來臺。對當前尚停留於武漢的台商，可透過陸委會建立之台商登錄資料一一追管，應主動對其表示關懷，以了解當地實際情況。
依據中國疾控中心截至22日通報資料，目前中國大陸31 省市（不含港澳特別政區）中共24 省市有確診病例，累計確診571例個案，其中95例重症，累計17例死亡。其中1月22日新增8例死亡個案，除1例為53歲外，其餘7例均為65歲以上，分別有癌症術後、肝功能不全、高血壓、糖尿病等慢性潛在性疾病，均為湖北省個案。密切接觸者 5,897人，追蹤中4,928人。其他國家及地區確診個案共11例，包括泰國4例、香港2例，台灣、日本、南韓、美國及澳門各1例。
因應大陸武漢肺炎疫情，指揮中心持續加強疫情監測與邊境管制措施，並針對國際及小三通港埠之入境發燒旅客全面詢問武漢旅遊史及進行健康評估。自去(2019)年12月31日啟動由武漢直航入境班機之登機檢疫，已執行38航班，共檢疫4,625名旅客及機組員，無新增後送個案。昨(22)日新增45例通報，截至目前共通報65名嚴重特殊傳染性肺炎個案，其中1名確診(1月21日已公布)、10名已排除、54名隔離檢驗中。另1月21日確診個案，目前持續於醫院負壓隔離病房治療中，46位接觸者除1位輕微咳嗽無發燒，其餘皆無異常。
指揮中心再次呼籲，中國大陸武漢市旅遊疫情建議已提升至第三級警告(Warning)，且當地公共交通運輸全數暫停營運，提醒民眾如非必要應避免前往當地。若需前往，應落實肥皂勤洗手、咳嗽配戴口罩等個人衛生措施，避免接觸野生動物及急性呼吸道感染症患者，也避免出入傳統市場及醫療院所。自武漢及其鄰近區域返國入境時，如出現發燒、咳嗽、呼吸急促等症狀，無論是否服用退燒藥、止咳藥，請主動向機場或港口檢疫人員報到，接受健康評估；返國14日內出現有發燒、呼吸道症狀時，請撥打免付費防疫專線1922或(0800-001922)專線並依指示配戴口罩儘速就醫，就醫時主動告知醫師旅旅遊史、職業別、接觸史及是否群聚(TOCC)，以及時診斷通報。其他「嚴重特殊傳染性肺炎」相關資訊，可參閱疾管署網站(https://www.cdc.gov.tw)。